More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4419 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 456 aa  919    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  53.2 
 
 		 438 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  49.29 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  44.82 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  45.11 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  43.26 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  40.81 
 
 		 458 aa  305  8.000000000000001e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  39.61 
 
 		 449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  38.22 
 
 		 480 aa  286  4e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  29.88 
 
 		 445 aa  211  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  30.35 
 
 		 439 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  30.09 
 
 		 437 aa  183  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  30.69 
 
 		 440 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.48 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 		 445 aa  159  9e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  33.42 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  31.69 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.73 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 		 442 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.07 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 440 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.75 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.94 
 
 		 441 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  28.37 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 		 467 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 438 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 431 aa  103  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 452 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 424 aa  97.8  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 417 aa  96.3  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  29.27 
 
 		 430 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  26.97 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 421 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.79 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 446 aa  86.7  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 420 aa  86.7  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 429 aa  86.7  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.17 
 
 		 444 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 		 434 aa  83.2  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4955  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.6 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2997  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000366828  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  23.34 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1478  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.64 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000417686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 461 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 404 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.68 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  29.15 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 504 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  22.32 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>