153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3964 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 435 aa  869    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  47.39 
 
 		 438 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  43.89 
 
 		 462 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  39.95 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  42.18 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  38.52 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  38.5 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  37.07 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  36.93 
 
 		 433 aa  249  7e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  40.29 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  38.19 
 
 		 422 aa  243  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  35.61 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  34.52 
 
 		 450 aa  239  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  36.29 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  37.36 
 
 		 438 aa  224  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  34.32 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  35.28 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  34.83 
 
 		 428 aa  209  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  37.02 
 
 		 441 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  33.59 
 
 		 433 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  33.17 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  31.36 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 417 aa  153  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.17 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  29.86 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  29.47 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  26.85 
 
 		 437 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  31.44 
 
 		 229 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 442 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  26.08 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.41 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  21.59 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.67 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  24.38 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 480 aa  69.3  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.69 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.26 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.38 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.18 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  22.7 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 424 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.76 
 
 		 426 aa  57  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  21.7 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.57 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 504 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.43 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.67 
 
 		 453 aa  53.9  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 410 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 446 aa  53.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.7 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.42 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 		 467 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.92 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 		 522 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  28.57 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.83 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 		 438 aa  50.4  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.92 
 
 		 431 aa  50.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 459 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  29.31 
 
 		 157 aa  49.7  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 428 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>