163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2644 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 431 aa  896    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  36.89 
 
 		 430 aa  294  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  37.14 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  30.6 
 
 		 432 aa  219  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  31.47 
 
 		 438 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  30.15 
 
 		 434 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 462 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 452 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  27.15 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  30.83 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  28 
 
 		 432 aa  154  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  28.77 
 
 		 435 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  30.12 
 
 		 435 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 433 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  28.94 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.67 
 
 		 450 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  26.08 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  28.64 
 
 		 438 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 428 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  25.93 
 
 		 437 aa  123  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 449 aa  113  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  25.64 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.58 
 
 		 458 aa  107  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  29.3 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 439 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 456 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.25 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 		 440 aa  97.4  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.44 
 
 		 444 aa  97.1  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 446 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 480 aa  94  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 		 450 aa  89.7  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.51 
 
 		 447 aa  89.7  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.58 
 
 		 441 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.59 
 
 		 453 aa  88.2  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 		 434 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 467 aa  86.7  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  29.91 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.25 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  23.8 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.02 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.83 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  23.2 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.24 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.73 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 454 aa  63.2  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.86 
 
 		 440 aa  63.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.08 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  20.75 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  21.68 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0041  extracellular solute-binding protein  21.54 
 
 		 460 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  21.88 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  31.52 
 
 		 157 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.68 
 
 		 438 aa  55.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  20.63 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  20.34 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 454 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  20.72 
 
 		 424 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>