92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0393 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 434 aa  882    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  51.03 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  48.74 
 
 		 432 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  47.24 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  44.99 
 
 		 432 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  46.51 
 
 		 428 aa  348  9e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  45.14 
 
 		 422 aa  339  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  43.42 
 
 		 433 aa  335  9e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  40.52 
 
 		 450 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  41.78 
 
 		 447 aa  330  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  41.98 
 
 		 433 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  39.86 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  39.95 
 
 		 424 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  41.15 
 
 		 435 aa  277  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  37.68 
 
 		 462 aa  274  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  39.52 
 
 		 433 aa  260  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  38.46 
 
 		 434 aa  252  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  39.29 
 
 		 430 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  41.25 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  40.41 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  37.39 
 
 		 438 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  34.9 
 
 		 450 aa  196  9e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 431 aa  144  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  29.95 
 
 		 417 aa  139  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  30.89 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.4 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  30.03 
 
 		 410 aa  127  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 452 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  33 
 
 		 229 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 420 aa  96.7  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  29.18 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  27.86 
 
 		 437 aa  92.8  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 442 aa  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 424 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  28.28 
 
 		 434 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  28.36 
 
 		 456 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.14 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 445 aa  83.2  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  29.37 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  30.03 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.67 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.82 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  26.09 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.26 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.98 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  21.83 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.92 
 
 		 458 aa  54.3  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 455 aa  54.3  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.45 
 
 		 444 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  21.08 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  23.31 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 432 aa  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.45 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  18.97 
 
 		 449 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  34.38 
 
 		 157 aa  46.6  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.32 
 
 		 431 aa  45.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  30.94 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  22.72 
 
 		 447 aa  44.3  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 408 aa  43.9  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 410 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 450 aa  43.1  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  21.63 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>