More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2031 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 442 aa  892    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  53.5 
 
 		 434 aa  458  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  46.78 
 
 		 444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  42.22 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  36.1 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  36.8 
 
 		 424 aa  242  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  36.8 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  34 
 
 		 446 aa  233  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  32.79 
 
 		 452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  31.17 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  28.75 
 
 		 457 aa  176  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  33.5 
 
 		 410 aa  172  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 421 aa  160  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  28.78 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  29.68 
 
 		 418 aa  150  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 424 aa  146  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  27.72 
 
 		 421 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 421 aa  140  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 438 aa  140  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  29.18 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.64 
 
 		 444 aa  133  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 		 455 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 434 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  28.94 
 
 		 456 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.88 
 
 		 450 aa  126  9e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.81 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.06 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 480 aa  124  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  29.48 
 
 		 449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 445 aa  119  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.16 
 
 		 453 aa  119  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.04 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  26.18 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 439 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.44 
 
 		 416 aa  106  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 440 aa  104  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 422 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.96 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.57 
 
 		 431 aa  94.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.9 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 427 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  25.61 
 
 		 432 aa  94  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 		 504 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 411 aa  90.9  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 444 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 424 aa  87.8  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  31.22 
 
 		 229 aa  87  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.51 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.89 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  25.37 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15060  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.49 
 
 		 457 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.138683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.05 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.82 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  23.68 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 410 aa  76.3  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.78 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  26.08 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.11 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.22 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  25.12 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>