More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0968 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  99.76 
 
 
411 aa  828    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
411 aa  833    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  99.51 
 
 
411 aa  826    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1276  extracellular solute-binding protein family 1  73.44 
 
 
417 aa  617  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000485827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  61.8 
 
 
410 aa  528  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  61.56 
 
 
410 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  49.08 
 
 
419 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  49.34 
 
 
419 aa  362  6e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  49.34 
 
 
419 aa  362  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  48.56 
 
 
419 aa  360  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  48.82 
 
 
419 aa  358  8e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  48.56 
 
 
419 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  48.56 
 
 
419 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  49.33 
 
 
419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  48.56 
 
 
419 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  48.56 
 
 
419 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  48.03 
 
 
419 aa  352  5e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  40 
 
 
401 aa  276  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  36.6 
 
 
432 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  33.42 
 
 
408 aa  216  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  33.51 
 
 
424 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  33.41 
 
 
395 aa  206  5e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  33.58 
 
 
398 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 
391 aa  194  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 
391 aa  193  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  31.48 
 
 
400 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  32.38 
 
 
397 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
392 aa  184  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
392 aa  184  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 
423 aa  176  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 
423 aa  176  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  31.57 
 
 
390 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 
413 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  30.62 
 
 
393 aa  172  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  32.51 
 
 
401 aa  171  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2152  extracellular solute-binding protein family 1  30.67 
 
 
415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.410183  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5151  extracellular solute-binding protein family 1  29.68 
 
 
400 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  30.26 
 
 
400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 
397 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 
415 aa  158  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0832  multiple sugar transport system substrate-binding protein  27.59 
 
 
416 aa  156  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.669088  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  29.76 
 
 
408 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  30.88 
 
 
392 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0294  maltose ABC transporter periplasmic protein  31.3 
 
 
406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.491527  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2135  maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein MalE  30.53 
 
 
410 aa  153  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12290  maltose-binding periplasmic protein  28.76 
 
 
422 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  31.13 
 
 
416 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3132  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.79 
 
 
395 aa  150  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal  0.0111617 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  29.05 
 
 
408 aa  149  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  29.66 
 
 
425 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.4 
 
 
396 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0238  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.98 
 
 
396 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.941451 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03906  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.4 
 
 
396 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3962  extracellular solute-binding protein family 1  29.4 
 
 
396 aa  144  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03866  hypothetical protein  29.4 
 
 
396 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5515  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.4 
 
 
396 aa  144  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.241432  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4496  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.4 
 
 
396 aa  144  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4274  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.4 
 
 
396 aa  144  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4586  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.4 
 
 
396 aa  144  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  29.51 
 
 
411 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.5 
 
 
403 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4572  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.75 
 
 
396 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0168981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4486  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.75 
 
 
396 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4571  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.75 
 
 
396 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4623  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.75 
 
 
396 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.108824 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4421  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.75 
 
 
396 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100315 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.5 
 
 
403 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.5 
 
 
403 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.4 
 
 
397 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5891  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 
402 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.403986 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
440 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0694  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 
415 aa  136  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3077  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 
417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  27.15 
 
 
467 aa  129  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  30.7 
 
 
400 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5856  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 
450 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0940  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.23 
 
 
409 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69507  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  30.7 
 
 
400 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3325  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.75 
 
 
422 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  28.3 
 
 
400 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
439 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0744  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 
432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0587531  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1527  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1485  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 
424 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22450  maltose-binding periplasmic protein  25.06 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.326435  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4686  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 
444 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.749978  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 
406 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3696  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 
546 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772784  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2174  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 
410 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.128166  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0632  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 
434 aa  99  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04140  maltose-binding periplasmic protein  24.5 
 
 
449 aa  98.6  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0206  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
433 aa  98.6  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568957  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2649  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 
400 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 
424 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1865  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 
454 aa  96.7  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2162  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 
415 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.183799  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13860  maltose-binding periplasmic protein  23.56 
 
 
412 aa  94.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1853  maltose ABC transporter substrate binding protein  27.12 
 
 
409 aa  93.6  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225735  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 
411 aa  92.8  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>