205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1891 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 447 aa  918    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  58.09 
 
 		 450 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  45.22 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  46.83 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  45.02 
 
 		 432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  42.48 
 
 		 434 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  42.08 
 
 		 432 aa  349  6e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  42.05 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  42.69 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  41.95 
 
 		 433 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  40.67 
 
 		 422 aa  309  8e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  35.94 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  35.24 
 
 		 462 aa  257  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  37.13 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  35.21 
 
 		 424 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  32.81 
 
 		 434 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  33.72 
 
 		 433 aa  210  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  34.48 
 
 		 430 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  34.23 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  32.2 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  32.21 
 
 		 450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  33.85 
 
 		 441 aa  169  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 431 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 452 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  28.77 
 
 		 430 aa  127  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 410 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  28.19 
 
 		 418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.57 
 
 		 416 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 420 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  33.14 
 
 		 229 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 449 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  28.43 
 
 		 437 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.42 
 
 		 450 aa  93.2  8e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 444 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.65 
 
 		 447 aa  90.1  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 445 aa  90.1  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 		 430 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  29 
 
 		 424 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 424 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.46 
 
 		 449 aa  87  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 457 aa  86.7  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  24.76 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.52 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.5 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.97 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 		 424 aa  67  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  21.4 
 
 		 438 aa  67  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 399 aa  67  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.63 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.7 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 454 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 454 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  19.17 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.4 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.4 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  25.42 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  24.6 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0255  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 430 aa  57  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  20.4 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  27.21 
 
 		 439 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.16 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>