162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1506 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  91.82 
 
 		 428 aa  795    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 428 aa  871    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  46.65 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  44.24 
 
 		 432 aa  338  9e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  44.73 
 
 		 432 aa  335  9e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  44.76 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  43.02 
 
 		 447 aa  319  5e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  41.76 
 
 		 433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  38.33 
 
 		 450 aa  302  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  41.69 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  39.11 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  39.63 
 
 		 433 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  36.27 
 
 		 462 aa  259  8e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  38.46 
 
 		 438 aa  249  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  35.37 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  37.88 
 
 		 430 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  33.18 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  35.02 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  35.68 
 
 		 438 aa  199  7.999999999999999e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  35.39 
 
 		 441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  34.62 
 
 		 446 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  32.16 
 
 		 450 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 417 aa  137  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 452 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.67 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  29.24 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.93 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 445 aa  93.6  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  30.81 
 
 		 229 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.32 
 
 		 450 aa  86.7  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 457 aa  86.7  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 480 aa  80.1  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  24.35 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  25.31 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  32.1 
 
 		 157 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.12 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.31 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.07 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.27 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 415 aa  67  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.93 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  20.94 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.85 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  22.75 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3075  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  21.76 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  24.92 
 
 		 430 aa  57  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  28.2 
 
 		 443 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.21 
 
 		 444 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 449 aa  54.7  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  22.68 
 
 		 454 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.89 
 
 		 426 aa  53.9  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 432 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  31.35 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  23.57 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  29.61 
 
 		 447 aa  50.1  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 449 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.89 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>