268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0048 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 434 aa  883    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  36.45 
 
 		 445 aa  293  4e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  38.85 
 
 		 441 aa  263  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  35.07 
 
 		 453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  35.14 
 
 		 437 aa  253  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  39.01 
 
 		 440 aa  250  4e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.33 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  38.14 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  33 
 
 		 438 aa  204  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  30.42 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  31.7 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  29.9 
 
 		 445 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.97 
 
 		 431 aa  186  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30 
 
 		 450 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  30.31 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.98 
 
 		 438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  30.71 
 
 		 454 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.18 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  28.82 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 480 aa  150  5e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.64 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.3 
 
 		 449 aa  129  8.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  24.27 
 
 		 437 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 431 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 424 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  21.98 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1594  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 961 aa  76.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.06 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.16 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 		 427 aa  67  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 504 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  24.76 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  24.38 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.39 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  24.67 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  22.78 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  25.35 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  21.08 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  21.45 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1045  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0733801  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.29 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  29.46 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.01 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  21.95 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 458 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.87 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2195  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  20.57 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  21.63 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  21.41 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>