255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0842 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 432 aa  888    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  63.08 
 
 		 433 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  46.24 
 
 		 422 aa  363  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  44.5 
 
 		 432 aa  362  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  45.36 
 
 		 434 aa  360  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  46.95 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  40.66 
 
 		 438 aa  332  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  41.9 
 
 		 462 aa  326  6e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  43.43 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  43.03 
 
 		 447 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  44.66 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  42.06 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  41.6 
 
 		 450 aa  317  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  40.3 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  38.23 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  38.75 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  38.48 
 
 		 430 aa  249  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  36.11 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  36.36 
 
 		 438 aa  244  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  36.88 
 
 		 446 aa  240  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  36.86 
 
 		 441 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  31 
 
 		 431 aa  217  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 		 417 aa  192  8e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  32.85 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.05 
 
 		 416 aa  176  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 		 452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 452 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  29.8 
 
 		 430 aa  160  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  31.18 
 
 		 410 aa  160  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  31.16 
 
 		 418 aa  159  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.58 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.55 
 
 		 450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 445 aa  111  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  26.58 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 442 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 434 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  33.15 
 
 		 229 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.06 
 
 		 447 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.09 
 
 		 453 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 		 424 aa  99.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 421 aa  97.8  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 467 aa  96.7  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.33 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 438 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 457 aa  94  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 456 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 437 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  23.72 
 
 		 437 aa  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.28 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  36.97 
 
 		 157 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.32 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  28.62 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  21.85 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 		 504 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.89 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.58 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  27.99 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  27.99 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.23 
 
 		 445 aa  67  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.68 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  20.64 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.4 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  21.34 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  20.88 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 449 aa  63.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>