More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1927 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 439 aa  896    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  34.08 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  36.96 
 
 		 440 aa  232  9e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  34.17 
 
 		 437 aa  229  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.91 
 
 		 453 aa  229  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  33.99 
 
 		 449 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  30.12 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30.22 
 
 		 450 aa  203  4e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  30.35 
 
 		 456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.6 
 
 		 431 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  30.63 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  30.31 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.65 
 
 		 447 aa  179  9e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.46 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.82 
 
 		 449 aa  160  4e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  27.29 
 
 		 444 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.75 
 
 		 458 aa  151  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.77 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 440 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  30.66 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 430 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 442 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 424 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 444 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 452 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 452 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 424 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.46 
 
 		 420 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 434 aa  89  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 457 aa  87.8  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 438 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 446 aa  86.7  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 454 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  24.61 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 441 aa  83.2  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.19 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 434 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.33 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.83 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  22.09 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  22.49 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  23.65 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.25 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  22.12 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  30.18 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 461 aa  69.7  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 504 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 		 520 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.51 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4955  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  34.52 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  25.27 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  26.75 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  27.82 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.14 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  29.71 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.94 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>