93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4955 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4955  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 458 aa  927    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  25.48 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.39 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  27.94 
 
 		 442 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  22.51 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  29.5 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.86 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27 
 
 		 431 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 466 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 419 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2162  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.183799  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 421 aa  53.9  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.88 
 
 		 438 aa  53.5  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  22.64 
 
 		 447 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  30.39 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  28.91 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 414 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.45 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5528  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.64 
 
 		 485 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  23.34 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  21.27 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04140  maltose-binding periplasmic protein  28.23 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  25.96 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 434 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 424 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 424 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.1 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 		 451 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.46 
 
 		 435 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 452 aa  47.4  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  20.28 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 447 aa  47.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 421 aa  46.6  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  31.03 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  31.06 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0508  extracellular solute-binding protein family 1  20.63 
 
 		 514 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13860  maltose-binding periplasmic protein  25.12 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  30.06 
 
 		 282 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  22.04 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.55 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2576  extracellular solute-binding protein family 1  22.28 
 
 		 614 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  31.97 
 
 		 498 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 434 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 442 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0129  extracellular solute-binding protein family 1  30.07 
 
 		 426 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 442 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  21.49 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  20.53 
 
 		 423 aa  43.9  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 433 aa  43.9  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1638  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.5 
 
 		 434 aa  43.5  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000325816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 		 427 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 435 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1485  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 		 424 aa  43.1  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 448 aa  43.1  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  22.5 
 
 		 421 aa  43.1  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>