More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0178 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 449 aa  891    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  40.38 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  34.78 
 
 		 447 aa  215  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 		 421 aa  123  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0636  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 415 aa  117  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000210277  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 415 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0661  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 415 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000689748  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0752  putative extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2876  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 451 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07110  carbohydrate-binding protein  25.33 
 
 		 462 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 424 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.06 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 424 aa  94  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 497 aa  93.6  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0965  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 455 aa  93.2  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 437 aa  88.2  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.92 
 
 		 419 aa  86.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 417 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0015  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3456  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.13 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.1 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.1 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0747  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.01 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  26.09 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29420  carbohydrate-binding protein  24 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.46 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2716  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.835001  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  22.19 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  21.28 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2511  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  21.05 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.98381  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0276  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00588273  hitchhiker  0.000015311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.32 
 
 		 403 aa  69.7  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  29.19 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.44 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.4 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  21.54 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3624  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  21.62 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 412 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.22 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.2 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.2 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.16 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.11 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2274  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 1012 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4429  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2263  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3271  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  22.56 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3143  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536467  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.82 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2057  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112802  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4566  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 504 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>