141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2876 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2876  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 451 aa  910    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  44.34 
 
 		 451 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07110  carbohydrate-binding protein  41.99 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0015  extracellular solute-binding protein family 1  43.8 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2263  extracellular solute-binding protein family 1  44.52 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29420  carbohydrate-binding protein  38.86 
 
 		 445 aa  300  5e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0752  putative extracellular solute-binding protein  37.16 
 
 		 439 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0965  extracellular solute-binding protein family 1  35.33 
 
 		 455 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.74 
 
 		 456 aa  239  8e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 424 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  30.45 
 
 		 447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2716  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.835001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2511  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  24.4 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.98381  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3456  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0748  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 487 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  24.16 
 
 		 448 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 415 aa  90.5  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 		 449 aa  90.1  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  22.12 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0636  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000210277  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0661  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000689748  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  23.06 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27 
 
 		 426 aa  67  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.39 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  21.69 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01220  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.19 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  28.34 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 404 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 441 aa  56.6  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  21.14 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 433 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  25 
 
 		 439 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 480 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.88 
 
 		 449 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  20.73 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.3 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  22.27 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  22.31 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 420 aa  50.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  21.82 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  24.91 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 447 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 442 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.26 
 
 		 416 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  20.9 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.26 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0496  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 453 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 455 aa  47.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  21.17 
 
 		 448 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.48 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 447 aa  47  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 416 aa  46.6  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  22.03 
 
 		 425 aa  46.6  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 456 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.57 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4572  maltose ABC transporter periplasmic protein  22.51 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0168981 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4571  maltose ABC transporter periplasmic protein  22.51 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4421  maltose ABC transporter periplasmic protein  22.51 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100315 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4486  maltose ABC transporter periplasmic protein  22.51 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4623  maltose ABC transporter periplasmic protein  22.51 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.108824 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.08 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>