More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4488 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 434 aa  895    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 		 447 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 414 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07110  carbohydrate-binding protein  27.63 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2876  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736508 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  28.15 
 
 		 451 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2716  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.835001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0015  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 470 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.09 
 
 		 419 aa  97.1  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.87 
 
 		 407 aa  96.7  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 437 aa  95.5  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.23 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  35.54 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  35.54 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.81 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 487 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.81 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.45 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 454 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.35 
 
 		 456 aa  87.4  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 497 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29420  carbohydrate-binding protein  24.68 
 
 		 445 aa  86.7  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 421 aa  86.7  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 457 aa  86.3  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 416 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0965  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0752  putative extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2263  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431886  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  22.31 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3456  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  24.57 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 406 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 421 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.06 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.3 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0332  extracellular solute-binding protein family 1  23.57 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  21.88 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.65 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 504 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  26.02 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0186  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1291  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1548  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  32 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000392798  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.54 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2511  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  21.16 
 
 		 425 aa  69.7  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.98381  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  22.7 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.54 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.14 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.84 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0349  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  25.23 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  22.62 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  22.07 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0636  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000210277  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  21.64 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2252  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00844632  hitchhiker  0.0063434 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.82 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 459 aa  67  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 447 aa  67  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 447 aa  67  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  20 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>