292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2511 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2511  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  100 
 
 		 425 aa  882    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.98381  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  32.71 
 
 		 448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2716  extracellular solute-binding protein  33.26 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.835001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3456  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 444 aa  203  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0748  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 453 aa  173  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0965  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2876  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07110  carbohydrate-binding protein  24.45 
 
 		 462 aa  117  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29420  carbohydrate-binding protein  22.11 
 
 		 445 aa  110  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 497 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0752  putative extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0015  extracellular solute-binding protein family 1  22.34 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 437 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.74 
 
 		 456 aa  97.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2263  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  21.43 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0636  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000210277  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.43 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0661  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000689748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  30.08 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  27.07 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  21.05 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  21.16 
 
 		 434 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 422 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 446 aa  67  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  30.05 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  20.88 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  21.55 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  21.55 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01220  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.33 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  20.2 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.17 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  24.02 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3591  extracellular solute-binding protein  21.57 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3527  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  23.41 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1955  extracellular solute-binding protein family 1  22.06 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  hitchhiker  0.000475348 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.88 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  23.34 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.28 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 455 aa  56.2  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.47 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 443 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  24.66 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 504 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>