116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0015 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0015  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 470 aa  954    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29420  carbohydrate-binding protein  67.65 
 
 		 445 aa  556  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07110  carbohydrate-binding protein  54.23 
 
 		 462 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2263  extracellular solute-binding protein family 1  44.42 
 
 		 441 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2876  extracellular solute-binding protein family 1  43.49 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  42.65 
 
 		 451 aa  331  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0965  extracellular solute-binding protein family 1  36.66 
 
 		 455 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.61 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0752  putative extracellular solute-binding protein  35.28 
 
 		 439 aa  226  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 		 424 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 441 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 447 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2511  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  22.27 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.98381  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0748  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 453 aa  94  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  22.87 
 
 		 448 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 497 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3456  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 444 aa  88.2  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 449 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2716  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.835001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.04 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  22.7 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0636  extracellular solute-binding protein  21.35 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000210277  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0661  extracellular solute-binding protein  21.35 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000689748  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.05 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  21.55 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 456 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1548  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.62 
 
 		 438 aa  55.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000392798  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  29.46 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 445 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  22.5 
 
 		 427 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 412 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  20.23 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  20.23 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.88 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.22 
 
 		 426 aa  50.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  22.9 
 
 		 448 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1748  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 		 481 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  28.19 
 
 		 413 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  22.13 
 
 		 422 aa  50.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 488 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 488 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  24 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 406 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 412 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  21.58 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  21.32 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.14 
 
 		 464 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 420 aa  48.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 397 aa  48.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 		 458 aa  48.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 447 aa  47.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 455 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 436 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 418 aa  47.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  23.71 
 
 		 392 aa  46.6  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  22.47 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  23.37 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  23.37 
 
 		 408 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1639  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.102178  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.69 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 436 aa  45.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.14 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 440 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.68 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.58 
 
 		 449 aa  44.7  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>