More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0648 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 447 aa  897    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  44.24 
 
 		 441 aa  349  6e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  35.16 
 
 		 449 aa  213  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  27.85 
 
 		 487 aa  153  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2876  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  30.2 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 424 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07110  carbohydrate-binding protein  27.83 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 		 414 aa  134  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0015  extracellular solute-binding protein family 1  27.64 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29420  carbohydrate-binding protein  28.25 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.43 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28 
 
 		 456 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  27.99 
 
 		 422 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0752  putative extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 439 aa  110  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0965  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 		 455 aa  109  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.25 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.25 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0661  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000689748  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0636  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 415 aa  106  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000210277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.41 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 444 aa  100  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3456  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 444 aa  99  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 		 421 aa  98.2  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 427 aa  97.1  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2263  extracellular solute-binding protein family 1  28.89 
 
 		 441 aa  97.1  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 457 aa  96.7  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1773  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 421 aa  90.1  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0165592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 436 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 423 aa  89  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 432 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 410 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 399 aa  87.4  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2716  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 433 aa  87  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.835001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 414 aa  86.7  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.66 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2977  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.576527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  22.86 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 437 aa  82.8  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 431 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  22.39 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.95 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2511  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  21.43 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.98381  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.2 
 
 		 410 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  21.65 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18880  carbohydrate-binding protein  24.67 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.173455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0748  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.28 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12848  sn-glycerol-3-phosphate-binding lipoprotein ugpB  22.49 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1180  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.16 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.52 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  21.89 
 
 		 448 aa  73.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0942  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.254009  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.75 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  23.01 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2627  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00662506  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  24.36 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.15 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  22.68 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1508  extracellular solute-binding protein family 1  23.52 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.3 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  21.69 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  21.47 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.13 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>