More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2627 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2627  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 434 aa  897    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00662506  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 423 aa  90.1  6e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 415 aa  89.7  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.11 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 441 aa  83.2  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  35.64 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.91 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  23.11 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  29.32 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  29.32 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.95 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.01 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 459 aa  67  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  31.92 
 
 		 433 aa  67  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 424 aa  67  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.48 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  21.75 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.83 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  20.94 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.48 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.81 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.47 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 407 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.88 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  28.88 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  26.88 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18880  carbohydrate-binding protein  26.59 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.173455 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1283  extracellular solute-binding lipoprotein, putative  25.29 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  29.67 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  29.55 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.38 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.78 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2834  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  30.71 
 
 		 495 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0186  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1265  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0034  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  27.68 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  29.46 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2588  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 419 aa  57  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000485668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.23 
 
 		 438 aa  57  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1748  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 481 aa  57  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1527  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 465 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.922727  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 445 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.86 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30.85 
 
 		 450 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10950  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.86 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575293  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  28.8 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0255  extracellular solute-binding protein family 1  25.05 
 
 		 439 aa  55.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  22.47 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>