124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10950 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_10950  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 
423 aa  853    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  39.95 
 
 
432 aa  321  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  40.85 
 
 
426 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  41.31 
 
 
426 aa  296  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  40.28 
 
 
428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  40.85 
 
 
424 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2013  extracellular solute-binding protein family 1  37.53 
 
 
423 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.991542  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  38.59 
 
 
426 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30.07 
 
 
463 aa  203  4e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 
426 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 
426 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
432 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  27.62 
 
 
421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 
432 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  26.71 
 
 
434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 
407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 
420 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 
420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
416 aa  106  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
414 aa  106  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  25.63 
 
 
435 aa  102  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 
425 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0152  putative sugar-binding protein  26.15 
 
 
436 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3075  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  26.39 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.71 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 
429 aa  67  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 
435 aa  66.6  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 
418 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 
441 aa  60.1  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2834  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
459 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873121  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 
458 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
412 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 
417 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.88 
 
 
431 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 
412 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2627  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 
434 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00662506  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.58 
 
 
422 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  25.25 
 
 
439 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.84 
 
 
406 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  21.6 
 
 
399 aa  53.5  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 
422 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  22.08 
 
 
461 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 
495 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 
433 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 
423 aa  52  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  29.21 
 
 
431 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.38 
 
 
419 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.38 
 
 
419 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  21.36 
 
 
427 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 
446 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  22.56 
 
 
461 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.27 
 
 
434 aa  50.8  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  23.11 
 
 
441 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 
459 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3553  hypothetical protein  25.61 
 
 
427 aa  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  32.28 
 
 
460 aa  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 
434 aa  49.7  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  22.27 
 
 
467 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.68 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 
431 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
431 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
464 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  22.1 
 
 
450 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 
419 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 
436 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 
426 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  30.54 
 
 
443 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 
419 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1527  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  21.05 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
449 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1634  extracellular solute-binding protein  21.05 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 
434 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 
424 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 
480 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 
419 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 
435 aa  47.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0255  extracellular solute-binding protein family 1  22.08 
 
 
439 aa  47.4  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 
437 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 
432 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
437 aa  47  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.72 
 
 
428 aa  46.6  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  21.59 
 
 
437 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2164  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
430 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3591  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317951  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
419 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
437 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  21.96 
 
 
410 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 
441 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  29.29 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.66 
 
 
430 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  20.65 
 
 
427 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  21.45 
 
 
459 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 
415 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>