131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1283 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1283  extracellular solute-binding lipoprotein, putative  100 
 
 		 436 aa  891    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1046  extracellular solute-binding protein family 1  38.85 
 
 		 435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1043  extracellular solute-binding protein family 1  37.13 
 
 		 435 aa  280  5e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0034  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  34.4 
 
 		 438 aa  254  3e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  32.5 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2627  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00662506  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.96 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.47 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1111  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.689899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.52 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.09 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0181  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 595 aa  56.6  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000497192  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  24.21 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.73 
 
 		 438 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0322  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 435 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 488 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 488 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.68 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.75 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0508  extracellular solute-binding protein family 1  20.72 
 
 		 514 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.23 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.23 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.09 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  32.16 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  22.34 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 449 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 432 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 405 aa  50.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 415 aa  50.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  22.08 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7039  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  29.86 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  21.46 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2716  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.835001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.54 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1463  extracellular solute-binding protein family 1  29.67 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0129  extracellular solute-binding protein family 1  22.75 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 432 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  24.14 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1393  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 461 aa  47  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  21.14 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 423 aa  47  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 447 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.81 
 
 		 439 aa  46.6  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.03 
 
 		 403 aa  46.6  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.7 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.6 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  23.34 
 
 		 487 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  24.1 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 585 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  34.18 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  24.82 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.57 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  36.36 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.6 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.26 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3472  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  20.49 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1773  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 465 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.504545  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3366  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0942  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.254009  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.72 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>