More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1017 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 417 aa  848    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  49.39 
 
 		 457 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  31.55 
 
 		 450 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01220  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.76 
 
 		 466 aa  189  9e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 402 aa  123  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0508  extracellular solute-binding protein family 1  29.68 
 
 		 514 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5820  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.2 
 
 		 447 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.01 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 421 aa  113  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.3 
 
 		 407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 458 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 415 aa  106  6e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 		 435 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 406 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1748  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 481 aa  102  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  29.33 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 399 aa  99.8  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 420 aa  97.4  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 421 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 		 415 aa  96.3  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.71 
 
 		 422 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.95 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 		 419 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1702  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 422 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 436 aa  94  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2730  extracellular solute-binding protein family 1  22.52 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 403 aa  94  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.94 
 
 		 435 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 430 aa  93.2  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 442 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.74 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 454 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.63 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 443 aa  90.9  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  23.34 
 
 		 437 aa  90.5  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 425 aa  89.7  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.69 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 430 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2042  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 483 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000305417  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 430 aa  87  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.49 
 
 		 430 aa  86.7  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 441 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 437 aa  86.7  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 444 aa  86.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2791  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 		 402 aa  86.3  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.448693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  35.76 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.75 
 
 		 428 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0476  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 401 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  22.04 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.41 
 
 		 465 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  24.18 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  21.83 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  21.83 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.47 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 455 aa  82.8  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0748  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  24.81 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>