More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3276 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
420 aa  849    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  60.66 
 
 
461 aa  546  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  56.22 
 
 
466 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.68 
 
 
407 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 
436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  29.28 
 
 
444 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 
414 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 
431 aa  149  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 
423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3306  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 
431 aa  145  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 
432 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  28.03 
 
 
410 aa  144  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  28.03 
 
 
410 aa  144  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
431 aa  143  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 
441 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  29.78 
 
 
453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 
442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 
421 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 
410 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
452 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 
427 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 
410 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.41 
 
 
419 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 
424 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 
436 aa  122  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
433 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
429 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 
440 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 
433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3270  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 
435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 
453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
424 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  26.49 
 
 
403 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0845  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 
435 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 
435 aa  117  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 
441 aa  116  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 
420 aa  116  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.36 
 
 
406 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 
443 aa  113  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 
410 aa  113  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.06 
 
 
431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 
437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 
419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 
406 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 
438 aa  107  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 
435 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  25.93 
 
 
446 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 
417 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 
457 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 
411 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
455 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 
454 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 
441 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 
404 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 
397 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 
425 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
439 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
427 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 
430 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 
411 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 
437 aa  99.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.56 
 
 
426 aa  98.6  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  21.82 
 
 
437 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2846  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 
435 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 
419 aa  99  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1508  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 
451 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 
455 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.12 
 
 
437 aa  98.2  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
416 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 
437 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 
448 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.12 
 
 
437 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 
425 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 
437 aa  97.1  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 
425 aa  97.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 
399 aa  97.1  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 
430 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 
504 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3527  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 
436 aa  95.5  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
411 aa  95.5  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
411 aa  95.5  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
436 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 
444 aa  94.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 
415 aa  93.6  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 
411 aa  93.6  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 
445 aa  93.2  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 
445 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
402 aa  92.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 
456 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>