More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3538 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  100 
 
 
406 aa  821    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.15 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 
430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  28.02 
 
 
427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 
429 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  28.17 
 
 
414 aa  123  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 
466 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25.82 
 
 
434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
424 aa  120  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 
410 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  26.79 
 
 
410 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  26.79 
 
 
410 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 
411 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 
424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  27.94 
 
 
426 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 
410 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 
433 aa  117  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
461 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 
433 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 
420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 
411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.34 
 
 
439 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.05 
 
 
410 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 
411 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  29.68 
 
 
419 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 
430 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 
435 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 
391 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.47 
 
 
411 aa  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 
410 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 
504 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.63 
 
 
426 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  26.41 
 
 
447 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 
410 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 
415 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 
391 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.83 
 
 
403 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 
415 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 
425 aa  103  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.71 
 
 
431 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  24.88 
 
 
440 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
415 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 
446 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
419 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
445 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 
443 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 
433 aa  100  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.43 
 
 
366 aa  100  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  27.91 
 
 
428 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.48 
 
 
427 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5331  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.11 
 
 
431 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998389  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 
402 aa  99  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  29.18 
 
 
416 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  31.21 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 
437 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 
430 aa  97.8  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  30.26 
 
 
447 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 
432 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 
423 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 
421 aa  97.4  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 
413 aa  97.1  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
457 aa  97.1  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
443 aa  97.1  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 
453 aa  96.3  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.48 
 
 
422 aa  96.3  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 
441 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.79 
 
 
430 aa  95.5  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.45 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
417 aa  95.1  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 
432 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 
439 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3553  hypothetical protein  27.41 
 
 
427 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
392 aa  93.6  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  28.9 
 
 
420 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 
404 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.96 
 
 
430 aa  93.2  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 
424 aa  93.2  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 
453 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
415 aa  93.2  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 
455 aa  92.8  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 
438 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
392 aa  92.4  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
395 aa  92.8  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  28.23 
 
 
434 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 
410 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 
400 aa  91.3  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 
406 aa  90.5  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  28.01 
 
 
408 aa  90.1  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 
420 aa  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 
421 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 
419 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 
410 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>