More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3553 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3553  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  876    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5331  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  77.86 
 
 		 431 aa  677    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998389  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0637  extracellular solute-binding protein  48.95 
 
 		 425 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7590  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  35.66 
 
 		 447 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1180  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  37.59 
 
 		 421 aa  266  5.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1666  extracellular solute-binding protein  37.38 
 
 		 421 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3151  extracellular solute-binding protein  37.44 
 
 		 426 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.345086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0129  extracellular solute-binding protein family 1  36.45 
 
 		 426 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57996  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0174  extracellular solute-binding protein  36.89 
 
 		 426 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1773  extracellular solute-binding protein family 1  37.88 
 
 		 421 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0165592 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 		 444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0061  extracellular solute-binding protein family 1  27.9 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2834  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2252  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00844632  hitchhiker  0.0063434 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 441 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 445 aa  106  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.36 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 431 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 		 437 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 431 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 		 441 aa  97.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 399 aa  96.3  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1459  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.06 
 
 		 457 aa  95.5  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 452 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.41 
 
 		 406 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0632  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein, putative  26.98 
 
 		 458 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0538  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  26.98 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  26.98 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0482  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  26.98 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0569  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  26.98 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0606  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  26.98 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0625  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  26.59 
 
 		 458 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3527  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 436 aa  88.2  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0483  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 458 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4733  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  26.59 
 
 		 458 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0700  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  26.19 
 
 		 458 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2846  extracellular solute-binding protein family 1  28.79 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0322  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18880  carbohydrate-binding protein  25.86 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.173455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0113  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.270734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0476  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4566  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1508  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5587  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1527  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  21.45 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1634  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3306  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 431 aa  76.3  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.65 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  21.69 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0332  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0845  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.8 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.18 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.18 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.45 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312494  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.29 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5274  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3282  extracellular solute-binding protein  21.71 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2195  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 450 aa  69.7  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  22.63 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0862  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2662  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.377519  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0942  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.254009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  21.65 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0894  extracellular solute-binding protein family 1  23.8 
 
 		 470 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.444762  normal  0.144357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0791  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.721808  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2515  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.62 
 
 		 833 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0891124 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  23.51 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1702  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 422 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>