More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4083 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
417 aa  859    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  56.25 
 
 
406 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  53.25 
 
 
422 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  41.73 
 
 
420 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  35.04 
 
 
408 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  32.82 
 
 
421 aa  203  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  32.73 
 
 
445 aa  203  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 
403 aa  182  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 
393 aa  160  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  30.91 
 
 
422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0253  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30 
 
 
424 aa  145  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1955  extracellular solute-binding protein family 1  34.82 
 
 
419 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  hitchhiker  0.000475348 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  34.03 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  33.89 
 
 
414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  31.58 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  32.65 
 
 
425 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  28.02 
 
 
414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2792  extracellular solute-binding protein family 1  30.15 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 
425 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.17 
 
 
407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0630  extracellular solute-binding protein family 1  30.7 
 
 
410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.505283 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
411 aa  120  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.9 
 
 
416 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  30.29 
 
 
416 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  30.29 
 
 
416 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 
406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  27.53 
 
 
410 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 
411 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  27.53 
 
 
410 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 
421 aa  110  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
413 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 
488 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 
488 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
427 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
461 aa  106  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 
420 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 
411 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 
503 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 
460 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
417 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  28.03 
 
 
420 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
415 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 
415 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  29.84 
 
 
418 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 
417 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 
466 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 
443 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 
413 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 
430 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 
415 aa  100  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
410 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2614  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
461 aa  99.8  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000017055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 
423 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 
504 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.23 
 
 
426 aa  98.2  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 
479 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 
449 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
433 aa  97.1  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 
414 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.4 
 
 
410 aa  96.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.07 
 
 
411 aa  96.3  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 
424 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  29.57 
 
 
419 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.77 
 
 
366 aa  94.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.74 
 
 
427 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 
429 aa  94.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 
436 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  27.72 
 
 
410 aa  94  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.71 
 
 
452 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.97 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
433 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
437 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 
447 aa  90.5  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 
432 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 
410 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 
442 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
410 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
434 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
425 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 
445 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  26.67 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.27 
 
 
431 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  29.16 
 
 
419 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 
443 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 
432 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 
446 aa  87  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  25.97 
 
 
421 aa  87  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 
435 aa  86.7  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.83 
 
 
426 aa  86.3  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 
441 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 
444 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 
391 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.53 
 
 
419 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 
449 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>