More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0630 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0630  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
410 aa  828    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.505283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2792  extracellular solute-binding protein family 1  80.61 
 
 
411 aa  668    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  49.26 
 
 
422 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  44.7 
 
 
411 aa  345  6e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  35.41 
 
 
445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  38.02 
 
 
420 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  33.5 
 
 
421 aa  182  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  32.72 
 
 
422 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 
403 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  31.36 
 
 
408 aa  156  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 
393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 
406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  30.7 
 
 
417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  32.12 
 
 
414 aa  120  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  30.4 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  30.8 
 
 
409 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  29.21 
 
 
423 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.52 
 
 
416 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0253  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.77 
 
 
424 aa  99.4  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  28.79 
 
 
413 aa  96.3  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1955  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 
419 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  hitchhiker  0.000475348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 
427 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.94 
 
 
411 aa  87  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 
411 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.02 
 
 
366 aa  86.3  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 
443 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  26.54 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.54 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.62 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 
399 aa  76.3  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 
425 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 
504 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 
414 aa  72.8  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.29 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.44 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0476  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.22 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
488 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 
412 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.47 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  21.32 
 
 
439 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 
410 aa  66.2  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 
430 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.24 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 
449 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 
415 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 
410 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 
412 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 
434 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1773  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 
465 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.504545  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 
441 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
420 aa  64.3  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 
415 aa  64.3  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 
423 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  22.12 
 
 
436 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
415 aa  63.5  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  28.33 
 
 
400 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 
442 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 
363 aa  62  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.48 
 
 
431 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 
449 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  33.88 
 
 
418 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 
397 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
427 aa  60.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 
420 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 
411 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 
447 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 
424 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  23.1 
 
 
411 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 
419 aa  60.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  23.1 
 
 
411 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3143  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 
473 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536467  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  20.33 
 
 
437 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  21.65 
 
 
436 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  22.28 
 
 
445 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 
419 aa  59.7  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 
447 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 
503 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 
401 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
386 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  20.6 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 
483 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 
401 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>