More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3042 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
406 aa  833    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  60.89 
 
 
422 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  56.25 
 
 
417 aa  461  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  41.91 
 
 
420 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  35.37 
 
 
408 aa  220  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  32.67 
 
 
421 aa  215  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 
403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  31.7 
 
 
445 aa  193  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0253  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.43 
 
 
424 aa  154  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 
393 aa  150  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 
422 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2792  extracellular solute-binding protein family 1  28.89 
 
 
411 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0630  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 
410 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.505283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  34.58 
 
 
409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.94 
 
 
407 aa  126  9e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  34.08 
 
 
414 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  31.12 
 
 
425 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  28.21 
 
 
410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  28.21 
 
 
410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  29 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  29 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1955  extracellular solute-binding protein family 1  30.32 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  hitchhiker  0.000475348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.13 
 
 
416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 
436 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 
418 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  28.27 
 
 
504 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 
410 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  26.87 
 
 
427 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 
411 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 
423 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 
444 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 
425 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  28.85 
 
 
411 aa  106  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 
420 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 
411 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 
413 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.65 
 
 
366 aa  103  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.25 
 
 
410 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 
417 aa  102  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 
415 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 
414 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 
432 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 
443 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 
410 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  22.3 
 
 
421 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 
460 aa  100  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 
411 aa  99.8  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 
454 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  27.99 
 
 
445 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
417 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 
414 aa  97.4  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 
425 aa  97.1  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 
414 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
457 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 
427 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 
406 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 
415 aa  93.6  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
424 aa  93.2  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 
419 aa  92.8  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  29.11 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 
442 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 
444 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 
453 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.75 
 
 
426 aa  89.7  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 
430 aa  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 
479 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
433 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4883  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.33 
 
 
417 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134037  normal  0.0630481 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 
419 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 
415 aa  87.8  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
433 aa  88.2  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 
441 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
488 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 
488 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 
449 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.19 
 
 
431 aa  86.3  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.69 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 
415 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  26.44 
 
 
404 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 
419 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
437 aa  83.6  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
404 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.1 
 
 
426 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  23.2 
 
 
439 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  25.07 
 
 
447 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  26 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 
503 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  22.29 
 
 
461 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 
466 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2730  extracellular solute-binding protein family 1  22.02 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.56 
 
 
431 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>