More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1138 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
423 aa  843    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1955  extracellular solute-binding protein family 1  60.05 
 
 
419 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  hitchhiker  0.000475348 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  51.08 
 
 
409 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  47.4 
 
 
414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  47.16 
 
 
416 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  47.12 
 
 
425 aa  329  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  32.56 
 
 
408 aa  187  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  33.61 
 
 
420 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  31.07 
 
 
445 aa  153  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 
393 aa  150  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  30.29 
 
 
422 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  31.09 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
411 aa  130  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 
403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2792  extracellular solute-binding protein family 1  31.41 
 
 
411 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
406 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  30.24 
 
 
422 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.36 
 
 
406 aa  107  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0253  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.8 
 
 
424 aa  106  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0630  extracellular solute-binding protein family 1  29.21 
 
 
410 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.505283 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 
421 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 
433 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  27 
 
 
427 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
424 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 
423 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 
433 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 
410 aa  92.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 
410 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 
433 aa  91.7  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 
420 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.46 
 
 
438 aa  88.6  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 
401 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 
455 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 
435 aa  87.8  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
411 aa  87  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 
414 aa  86.7  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 
443 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  27.27 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  26.98 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  32.14 
 
 
445 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15060  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.92 
 
 
457 aa  84.7  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.138683  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 
456 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 
514 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.46 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 
447 aa  82.8  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 
460 aa  80.9  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.54 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.38 
 
 
431 aa  79.7  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 
417 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 
441 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  29.46 
 
 
430 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.91 
 
 
426 aa  77.4  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1548  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.99 
 
 
438 aa  77  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000392798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.59 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.46 
 
 
431 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 
435 aa  73.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.15 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03906  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.15 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3962  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03866  hypothetical protein  27.15 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  21.55 
 
 
414 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5515  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.15 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.241432  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4496  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.15 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4274  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.15 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4586  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.15 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  21.96 
 
 
416 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  21.96 
 
 
416 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1291  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
461 aa  71.6  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  29.85 
 
 
447 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.9 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.9 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.9 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4572  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.82 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0168981 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4421  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.82 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100315 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4623  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.82 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.108824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4571  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.82 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 
454 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4486  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.51 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.09 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>