More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6090 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 425 aa  861    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  48.1 
 
 		 435 aa  362  8e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 424 aa  122  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 424 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 		 426 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 423 aa  106  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.03 
 
 		 411 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.69 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.74 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.98 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 		 422 aa  100  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.84 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 		 450 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 437 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 422 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 427 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.12 
 
 		 422 aa  94  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 		 410 aa  94  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.12 
 
 		 422 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1955  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 419 aa  93.2  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  hitchhiker  0.000475348 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  23.38 
 
 		 434 aa  88.2  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 451 aa  87  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  22.65 
 
 		 430 aa  86.7  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.2 
 
 		 407 aa  86.7  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  26.29 
 
 		 409 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  22.41 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  25.47 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.53 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  29.19 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.14 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5476  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.487316 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5213  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.506772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0152  putative sugar-binding protein  29.74 
 
 		 436 aa  76.3  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.69 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0954  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233769  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0804  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793174  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.69 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  23.7 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.1 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  26.96 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  23.41 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  29.03 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  23.41 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  27.72 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4092  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518601  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  20.05 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>