277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0152 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0152  putative sugar-binding protein  100 
 
 		 436 aa  869    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  79.8 
 
 		 435 aa  650    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  64.97 
 
 		 434 aa  564  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  45.3 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  45.3 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  46.65 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  44.15 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  45.43 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  41.65 
 
 		 432 aa  355  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  36.12 
 
 		 425 aa  295  8e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 		 407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 420 aa  160  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.36 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.45 
 
 		 463 aa  136  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2013  extracellular solute-binding protein family 1  26.81 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.991542  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 414 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3075  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  30 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.25 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10950  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.03 
 
 		 423 aa  96.3  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575293  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 399 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 446 aa  93.2  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  26.75 
 
 		 434 aa  88.2  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.23 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  24.55 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  22.99 
 
 		 419 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  22.6 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.47 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.4 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  20.52 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04930  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.54 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.99 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.74 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  20.91 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5097  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  27.72 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3591  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.18 
 
 		 416 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 455 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 		 416 aa  67  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  23.2 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2305  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.03 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.31 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.33 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.28 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2293  extracellular solute-binding protein family 1  21.68 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0656119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.62 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  22.12 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.34 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>