More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1023 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 422 aa  842    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  44.82 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  44.78 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  44.53 
 
 		 430 aa  358  7e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  43.78 
 
 		 440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  39.11 
 
 		 434 aa  292  8e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  33.78 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 424 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  32.24 
 
 		 427 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  30.37 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.45 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 459 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.69 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 486 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 		 423 aa  97.1  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.48 
 
 		 411 aa  94  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  24.4 
 
 		 421 aa  94  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 411 aa  94  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.92 
 
 		 407 aa  93.2  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.73 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.19 
 
 		 366 aa  90.9  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 427 aa  90.1  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.18 
 
 		 430 aa  89.7  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 419 aa  87.4  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 433 aa  86.7  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.7 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  21.86 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  24.11 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  21.68 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  21.53 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  21.5 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  21.39 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  20.65 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1380  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7337  ABC transporter substrate binding protein  25.44 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00127436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.93 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  26.6 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 504 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 393 aa  67  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 		 425 aa  67  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.43 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.43 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  21.77 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  22.13 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  21.54 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  25.68 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  20.42 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>