More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5476 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5213  extracellular solute-binding protein family 1  97.35 
 
 
415 aa  830    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.506772 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5476  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
415 aa  848    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.487316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  59.8 
 
 
426 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.21 
 
 
411 aa  117  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.1 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 
402 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.09 
 
 
406 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 
412 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 
412 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 
446 aa  94  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 
412 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0473  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 
420 aa  90.5  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 
419 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 
419 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 
419 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.15 
 
 
438 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 
415 aa  87  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 
424 aa  87  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 
410 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 
420 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  21.99 
 
 
425 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 
428 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  22.29 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.23 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 
399 aa  77  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.69 
 
 
410 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 
435 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  21.97 
 
 
421 aa  76.3  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 
432 aa  75.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  20.94 
 
 
432 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 
440 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 
440 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3270  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 
435 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0845  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 
435 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  21.99 
 
 
430 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  21.52 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3941  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 
490 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  22.68 
 
 
427 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  20.83 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 
504 aa  69.7  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5667  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  27.32 
 
 
439 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  19.6 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  22.28 
 
 
437 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  20.87 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.15 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 
420 aa  67  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
421 aa  66.6  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 
411 aa  66.2  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 
411 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 
433 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 
406 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
434 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2588  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 
419 aa  65.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000485668  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 
445 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 
418 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.39 
 
 
403 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  20.54 
 
 
431 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 
430 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  21.43 
 
 
430 aa  64.7  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.7 
 
 
424 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 
436 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 
430 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 
417 aa  63.9  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7590  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.22 
 
 
447 aa  63.5  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 
427 aa  63.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 
436 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01810  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.53 
 
 
415 aa  63.2  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 
442 aa  63.2  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 
419 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 
421 aa  63.2  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
411 aa  63.2  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 
437 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2297  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 
422 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>