More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2504 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
442 aa  910    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  28.45 
 
 
479 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  28.82 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 
420 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  27.2 
 
 
427 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 
443 aa  143  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 
421 aa  143  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 
427 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 
460 aa  137  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 
483 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 
454 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  29.69 
 
 
441 aa  133  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 
449 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 
421 aa  127  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 
454 aa  127  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  29.46 
 
 
439 aa  126  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.81 
 
 
416 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  26.92 
 
 
416 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
458 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 
415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 
503 aa  119  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 
429 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 
420 aa  117  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.03 
 
 
422 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 
414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  30.48 
 
 
411 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 
411 aa  114  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.38 
 
 
407 aa  113  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 
419 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.9 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  30.16 
 
 
445 aa  110  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 
430 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.46 
 
 
410 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 
418 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.56 
 
 
426 aa  106  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
488 aa  106  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 
411 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 
411 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.42 
 
 
431 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 
403 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  26.7 
 
 
410 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  26.7 
 
 
410 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
488 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 
413 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 
410 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 
510 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  28.17 
 
 
504 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  31.01 
 
 
445 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 
457 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 
410 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 
413 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 
422 aa  99  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  25.06 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 
447 aa  98.2  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 
363 aa  97.1  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 
415 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 
410 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
439 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 
408 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 
425 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
456 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 
480 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  21.17 
 
 
410 aa  94.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 
443 aa  94  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 
467 aa  94  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  31.02 
 
 
447 aa  94  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  22.34 
 
 
410 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.21 
 
 
430 aa  93.2  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 
422 aa  93.2  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 
432 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
424 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1468  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 
457 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 
413 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.37 
 
 
403 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 
393 aa  91.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
417 aa  92  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.64 
 
 
419 aa  91.3  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 
430 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 
425 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 
437 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  24.43 
 
 
408 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.83 
 
 
452 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 
417 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  29.28 
 
 
441 aa  89  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 
421 aa  88.2  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 
415 aa  88.2  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.71 
 
 
443 aa  87.8  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  21.15 
 
 
484 aa  87.8  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
428 aa  87.8  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  28.11 
 
 
424 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 
418 aa  86.7  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 
445 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 
441 aa  86.3  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 
431 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 
431 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 
434 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>