More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2345 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 424 aa  858    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  45.32 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  40.1 
 
 		 435 aa  336  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  40.05 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  40.65 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  39.48 
 
 		 448 aa  300  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  38.94 
 
 		 428 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  35.84 
 
 		 442 aa  278  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  36.77 
 
 		 441 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  35.32 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  37.92 
 
 		 422 aa  252  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  33.5 
 
 		 420 aa  234  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 435 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  28.67 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 444 aa  179  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  30.36 
 
 		 441 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  30.45 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  29.81 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 434 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  24.93 
 
 		 419 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  27.58 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  29.81 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.88 
 
 		 428 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.67 
 
 		 426 aa  123  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 		 424 aa  123  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.34 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 417 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 424 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  27.83 
 
 		 434 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.37 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  25.74 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  27.08 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 433 aa  110  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  29.11 
 
 		 436 aa  106  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 439 aa  106  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 470 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.55 
 
 		 410 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 468 aa  103  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  25.14 
 
 		 439 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.51 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 434 aa  96.7  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 412 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 412 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 417 aa  93.2  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 455 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 414 aa  89.7  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  29.44 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 441 aa  88.2  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  28.11 
 
 		 442 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 419 aa  86.3  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 421 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.02 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  27.13 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  23.31 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>