294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2754 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 443 aa  880    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  41.39 
 
 		 434 aa  300  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  40.7 
 
 		 429 aa  292  8e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  40.78 
 
 		 433 aa  289  7e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  40.19 
 
 		 431 aa  279  8e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  39.01 
 
 		 427 aa  278  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  40.95 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  37.25 
 
 		 427 aa  266  4e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  40.25 
 
 		 441 aa  257  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  36.68 
 
 		 424 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  37.82 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  34.09 
 
 		 436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  31.05 
 
 		 495 aa  202  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  31.28 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  32.37 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 435 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  30.23 
 
 		 451 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 441 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  30.35 
 
 		 424 aa  130  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  27.64 
 
 		 434 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  29.36 
 
 		 442 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  28.92 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 444 aa  106  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.35 
 
 		 438 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  28.49 
 
 		 441 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.14 
 
 		 435 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  29.59 
 
 		 442 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 448 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.78 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 424 aa  87.4  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.15 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  24.07 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.61 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  24.05 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  24.12 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  24.12 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.34 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  28.98 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 468 aa  69.7  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  30.27 
 
 		 470 aa  69.7  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.37 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  26.37 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  23.54 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.24 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.44 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.11 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 467 aa  59.7  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>