More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6933 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 412 aa  832    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3472  extracellular solute-binding protein family 1  36.97 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 412 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  28.71 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.33 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  32 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 		 495 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  36.17 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  22.28 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.76 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.85 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  33.1 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 463 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.24 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 463 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  31.79 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  21.63 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  34.23 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.76 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.76 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6548  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.07 
 
 		 490 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.09 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.52 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25.32 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  21.65 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.67 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  19.9 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.46 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.02 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0770  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1478  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.93 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000417686  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  25.88 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.85 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  31.85 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>