243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4889 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 429 aa  867    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0237  extracellular solute-binding protein family 1  56.64 
 
 		 444 aa  479  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  29.53 
 
 		 478 aa  116  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 442 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  26.08 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  32.2 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  31.02 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.37 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  31.25 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  31.9 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  23.49 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6548  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.45 
 
 		 490 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  21.77 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.5 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  25.77 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25.77 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.44 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  32.24 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  26.68 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.13 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.32 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.48 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  30.69 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  30.17 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  28.11 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  43.84 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.23 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  32.5 
 
 		 453 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  30.07 
 
 		 441 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 412 aa  57  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  33.13 
 
 		 441 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 466 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.64 
 
 		 463 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 495 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.1 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  26.45 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 455 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 439 aa  54.3  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 418 aa  54.3  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 432 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 450 aa  53.5  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2252  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00844632  hitchhiker  0.0063434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0171  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  28.42 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 434 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  22.47 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  37.84 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  29.86 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.51 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  21.14 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.46 
 
 		 429 aa  52.4  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  30.83 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>