228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1651 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
427 aa  888    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  64.41 
 
 
419 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  64.65 
 
 
419 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  63.77 
 
 
419 aa  568  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  67.26 
 
 
422 aa  570  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  63.7 
 
 
419 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  61.93 
 
 
417 aa  557  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  61.93 
 
 
419 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  61.59 
 
 
418 aa  547  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  64.69 
 
 
429 aa  542  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  63.68 
 
 
419 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  62.85 
 
 
419 aa  536  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  55.58 
 
 
422 aa  486  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  50.84 
 
 
458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 
427 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 
424 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.32 
 
 
419 aa  89.7  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 
428 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.29 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  32.24 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.63 
 
 
458 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.05 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.21 
 
 
408 aa  72.4  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 
434 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  30.8 
 
 
431 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 
422 aa  69.7  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 
463 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  22.1 
 
 
429 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 
408 aa  69.7  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 
463 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2997  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 
462 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000366828  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1759  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 
436 aa  68.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.071409  normal  0.0857732 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  27.91 
 
 
461 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 
424 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 
412 aa  67  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  22.51 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 
424 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 
429 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 
468 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 
470 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  27.57 
 
 
461 aa  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.74 
 
 
380 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 
451 aa  63.5  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.19 
 
 
412 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 
420 aa  63.2  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 
444 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  29.96 
 
 
434 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3472  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 
413 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 
452 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.17 
 
 
410 aa  62.4  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 
423 aa  62  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1947  extracellular solute-binding protein  21.13 
 
 
428 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.709657  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 
425 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 
429 aa  60.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 
424 aa  59.7  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 
440 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 
452 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 
451 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.34 
 
 
442 aa  58.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 
431 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
415 aa  57.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.08 
 
 
427 aa  57.8  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 
445 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 
427 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 
444 aa  57.4  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 
442 aa  56.6  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
455 aa  56.6  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 
424 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.08 
 
 
434 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0021  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.33 
 
 
428 aa  55.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 
441 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  21.81 
 
 
424 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
493 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
419 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 
435 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 
414 aa  55.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.38 
 
 
452 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 
431 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 
421 aa  54.3  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 
424 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 
443 aa  54.3  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 
461 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  24.48 
 
 
413 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 
431 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 
445 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 
441 aa  53.1  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1597  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 
456 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 
439 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  21.9 
 
 
495 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  24.09 
 
 
399 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>