218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1759 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1759  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 436 aa  893    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.071409  normal  0.0857732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3719  extracellular solute-binding protein family 1  42.75 
 
 		 441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.0540576 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2997  extracellular solute-binding protein family 1  38.98 
 
 		 462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000366828  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1478  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  36.49 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000417686  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.06 
 
 		 429 aa  73.2  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.61 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  22.47 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 417 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  21.85 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.04 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  21.79 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.73 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.47 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 408 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.32 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.43 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  23.54 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  22.45 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  23.67 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 456 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.31 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 410 aa  57  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  24.22 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  30.91 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3317  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 492 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000142443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  25.82 
 
 		 426 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.33 
 
 		 458 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  20.53 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  20.87 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  21.71 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.92 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 420 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  20.95 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 420 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 461 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 427 aa  53.9  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  20.31 
 
 		 419 aa  53.9  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 412 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 424 aa  53.5  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 405 aa  53.5  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 447 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 449 aa  53.5  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 451 aa  53.1  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.99 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  21.86 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.86 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  21.86 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.8 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.33 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2520  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.88 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  20.49 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>