More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2706 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  76.43 
 
 		 419 aa  686    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  76.94 
 
 		 419 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  75.71 
 
 		 418 aa  650    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  76.68 
 
 		 417 aa  670    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 422 aa  867    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  80.35 
 
 		 419 aa  671    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  77.09 
 
 		 419 aa  690    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  85.37 
 
 		 419 aa  732    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  78.74 
 
 		 419 aa  695    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  78.54 
 
 		 419 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  64.75 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  63.11 
 
 		 429 aa  539  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  59.18 
 
 		 422 aa  502  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  56.27 
 
 		 458 aa  464  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 427 aa  161  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 429 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 		 444 aa  89.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.21 
 
 		 441 aa  88.2  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 423 aa  86.3  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.98 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.92 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.93 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  31.58 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.35 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1947  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.709657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  29.06 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  29.11 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  31.15 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.2 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25.54 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.64 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3675  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 447 aa  67  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  31.02 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.68 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  27.39 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  27.1 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  27.16 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1759  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.071409  normal  0.0857732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.07 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1597  extracellular solute-binding protein family 1  31.78 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.31 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.27 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.57 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.03 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3472  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2997  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000366828  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  24.63 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  22.49 
 
 		 454 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>