158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1597 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1597  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 456 aa  930    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  30.1 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.19 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.07 
 
 		 458 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  30.62 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  22.13 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.94 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  24.71 
 
 		 413 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  24.71 
 
 		 399 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.94 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.16 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  21.34 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.05 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.38 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.27 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.96 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 419 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1478  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.04 
 
 		 439 aa  57  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000417686  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  22.57 
 
 		 437 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 425 aa  57  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  22.33 
 
 		 451 aa  57  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.93 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  21.98 
 
 		 434 aa  54.3  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 418 aa  53.9  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 418 aa  54.3  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 408 aa  53.9  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 446 aa  53.9  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 		 438 aa  53.5  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  24.7 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  37.97 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  23.53 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25 
 
 		 463 aa  51.2  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 452 aa  50.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 		 440 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  23.11 
 
 		 466 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.53 
 
 		 453 aa  50.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  22.17 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3719  extracellular solute-binding protein family 1  30.92 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.0540576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  22.22 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  21.17 
 
 		 449 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  28.23 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  29.28 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.85 
 
 		 380 aa  47.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.85 
 
 		 440 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 461 aa  47  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 478 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>