185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0115 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 478 aa  970    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  52.38 
 
 		 442 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  54.66 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  53.43 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  49.02 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.27 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 		 440 aa  103  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0237  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 423 aa  97.8  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 417 aa  89  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 408 aa  88.2  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  29.2 
 
 		 444 aa  87  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.09 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.87 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  26.07 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  21.69 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.94 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  25.12 
 
 		 413 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 452 aa  66.6  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25.12 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.22 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 631 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  31.45 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  29.65 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  25.88 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.72 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4609  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3675  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.49 
 
 		 412 aa  57  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  22.95 
 
 		 423 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  27.83 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 422 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 452 aa  55.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 424 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 455 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  26.81 
 
 		 466 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.09 
 
 		 429 aa  54.7  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3285  hypothetical protein  25.32 
 
 		 431 aa  54.3  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 466 aa  54.3  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 412 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 412 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 443 aa  53.5  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  21.92 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.53 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  22.49 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.47 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  29.11 
 
 		 425 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  23.7 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.74 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  23.2 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  27.75 
 
 		 437 aa  51.2  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.46 
 
 		 442 aa  51.2  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.67 
 
 		 406 aa  50.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2399  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.23 
 
 		 411 aa  50.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  20.72 
 
 		 441 aa  50.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  21.5 
 
 		 444 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 415 aa  50.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 435 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 419 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  25.11 
 
 		 442 aa  50.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 452 aa  50.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  29.19 
 
 		 412 aa  50.4  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 414 aa  50.4  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 440 aa  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 419 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  22.08 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>