139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1478 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1478  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 439 aa  899    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000417686  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1759  extracellular solute-binding protein family 1  36.03 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.071409  normal  0.0857732 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2997  extracellular solute-binding protein family 1  35.62 
 
 		 462 aa  266  4e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000366828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3719  extracellular solute-binding protein family 1  34.47 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.0540576 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.03 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.69 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.38 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.52 
 
 		 441 aa  57  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 		 461 aa  57  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.32 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 433 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.1 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 422 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3669  extracellular solute-binding protein family 1  29.45 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 495 aa  53.5  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 422 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 		 420 aa  53.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 520 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 445 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.19 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  21.32 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  21.32 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  32.56 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4863  extracellular solute-binding protein family 1  29.45 
 
 		 492 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426159 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.54 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1113  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.04 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  29.38 
 
 		 437 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 425 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1292  glucose ABC transporter, periplasmic glucose-binding protein, putative  29.17 
 
 		 428 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.927491  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 		 428 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 427 aa  50.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3317  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 492 aa  50.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000142443  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  23.57 
 
 		 432 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 429 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 414 aa  50.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 428 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.88 
 
 		 431 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  20.69 
 
 		 442 aa  50.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0237  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.91 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.22 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1115  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000327347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  21.69 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0175  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.48 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  28.71 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0021  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.19 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  21.82 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.31 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  21.52 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5409  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.11 
 
 		 457 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.72 
 
 		 453 aa  47.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  26.82 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  21.43 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 452 aa  47  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.85 
 
 		 422 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.88 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  26.44 
 
 		 420 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16871 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>