More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0175 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0175  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 458 aa  934    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3317  extracellular solute-binding protein  61.95 
 
 		 492 aa  565  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000142443  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  31.9 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1095  extracellular solute-binding protein family 1  33.57 
 
 		 530 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0063  extracellular solute-binding protein family 1  30.75 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4693  extracellular solute-binding protein family 1  29.88 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.363745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.87 
 
 		 444 aa  167  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  27.94 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8464  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.635867  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5409  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.96 
 
 		 457 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3703  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 466 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.53 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.83 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  28.71 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  23.8 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.43 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3669  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  26.26 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  28.75 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  28.75 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4863  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 492 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426159 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  23.57 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  24.77 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 495 aa  63.2  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  28.91 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 452 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.94 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.71 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  28.3 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 483 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  30.26 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.83 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.56 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 468 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  22.29 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 393 aa  57  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.06 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  29.47 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  27.6 
 
 		 416 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  29.07 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  27.6 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 393 aa  55.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  21.91 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  26.34 
 
 		 409 aa  55.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 		 447 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2315  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 925 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 421 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>