More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3317 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3317  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 492 aa  1009    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000142443  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0175  extracellular solute-binding protein family 1  61.95 
 
 		 458 aa  556  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1095  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 		 530 aa  186  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  32.78 
 
 		 520 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0063  extracellular solute-binding protein family 1  30.48 
 
 		 475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  28.98 
 
 		 466 aa  163  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4693  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 		 457 aa  163  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.363745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.69 
 
 		 444 aa  162  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5409  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.67 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8464  extracellular solute-binding protein family 1  26.81 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.635867  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3703  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 466 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0255  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  33.96 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 		 423 aa  73.2  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  31.98 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  31.34 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  26.63 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  32.65 
 
 		 409 aa  67  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  29.54 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  29.55 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 439 aa  66.6  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.22 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  28.33 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  29.18 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1955  extracellular solute-binding protein family 1  31.16 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  hitchhiker  0.000475348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.82 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.17 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  30.08 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 488 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4863  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426159 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  29.03 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.23 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  29.03 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3669  extracellular solute-binding protein family 1  23.03 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 408 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 411 aa  60.1  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 421 aa  60.1  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  34.01 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  24.04 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0894  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.444762  normal  0.144357 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.3 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  29.26 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.07 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1115  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000327347  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2418  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.23 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.16 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  29.1 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 431 aa  57  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>