More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2308 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
440 aa  908    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  31.01 
 
 
432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04140  maltose-binding periplasmic protein  31.96 
 
 
449 aa  209  7e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  32.38 
 
 
410 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  32.12 
 
 
410 aa  187  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2152  extracellular solute-binding protein family 1  31.18 
 
 
415 aa  173  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.410183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 
424 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  31.38 
 
 
401 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2135  maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein MalE  28.89 
 
 
410 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  27.35 
 
 
419 aa  159  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 
419 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  29.97 
 
 
408 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  26.97 
 
 
419 aa  147  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  26.97 
 
 
419 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  26.97 
 
 
419 aa  146  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  26.97 
 
 
419 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  26.52 
 
 
419 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  26.97 
 
 
419 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  26.97 
 
 
419 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 
419 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  26.74 
 
 
419 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1276  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000485827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3132  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.53 
 
 
395 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal  0.0111617 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 
406 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  28.24 
 
 
411 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
411 aa  136  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  27.94 
 
 
411 aa  136  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  28.42 
 
 
392 aa  133  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0294  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.38 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.491527  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.88 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 
413 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  28.68 
 
 
467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  29.39 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
391 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 
397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
418 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.16 
 
 
396 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 
398 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03906  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.16 
 
 
396 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3962  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 
396 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5515  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.16 
 
 
396 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.241432  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3325  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  32.5 
 
 
422 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4496  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.16 
 
 
396 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03866  hypothetical protein  28.16 
 
 
396 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4274  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.16 
 
 
396 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4586  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.16 
 
 
396 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 
400 aa  124  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 
392 aa  124  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13860  maltose-binding periplasmic protein  32.89 
 
 
412 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  27.68 
 
 
408 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1527  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 
412 aa  120  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
390 aa  120  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.63 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.77 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.77 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.77 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
395 aa  116  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  27.68 
 
 
408 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4571  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.05 
 
 
396 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4486  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.05 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1485  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0744  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0587531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4623  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.05 
 
 
396 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.108824 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4421  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.05 
 
 
396 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0694  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4572  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.05 
 
 
396 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0168981 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.28 
 
 
400 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  29.28 
 
 
400 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0238  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.47 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
400 aa  113  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0632  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 
434 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5891  extracellular solute-binding protein family 1  29.67 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.403986 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  28.62 
 
 
400 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
393 aa  109  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0832  multiple sugar transport system substrate-binding protein  28.41 
 
 
416 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.669088  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2174  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 
410 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.128166  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2649  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 
400 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1853  maltose ABC transporter substrate binding protein  26.3 
 
 
409 aa  104  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0940  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.58 
 
 
409 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69507  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12290  maltose-binding periplasmic protein  30.69 
 
 
422 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0134652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5151  extracellular solute-binding protein family 1  23.8 
 
 
400 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2162  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 
415 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.183799  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22450  maltose-binding periplasmic protein  27.79 
 
 
439 aa  101  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.326435  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 
415 aa  96.7  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1295  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 
409 aa  96.7  7e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1781  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 
413 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 
410 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0206  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 
433 aa  94.4  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568957  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1151  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 
400 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5856  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 
450 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 
439 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>