217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2135 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2135  maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein MalE  100 
 
 
410 aa  845    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  37.15 
 
 
432 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  29.82 
 
 
419 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  29.57 
 
 
419 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  30.05 
 
 
419 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  29.8 
 
 
419 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  29.8 
 
 
419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  29.82 
 
 
419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  29.8 
 
 
419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  29.8 
 
 
419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  29.8 
 
 
419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 
419 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 
401 aa  172  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2152  extracellular solute-binding protein family 1  30.19 
 
 
415 aa  172  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.410183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 
440 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
419 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 
410 aa  169  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  29.23 
 
 
410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 
424 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 
413 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 
411 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  30.53 
 
 
411 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
423 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
423 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  30.53 
 
 
411 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1276  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000485827  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 
392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 
391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 
398 aa  133  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 
395 aa  133  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0294  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.48 
 
 
406 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.491527  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.41 
 
 
403 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
400 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.41 
 
 
403 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.41 
 
 
403 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03906  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.29 
 
 
396 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3962  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 
396 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03866  hypothetical protein  28.29 
 
 
396 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4274  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.29 
 
 
396 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4586  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.29 
 
 
396 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5515  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.29 
 
 
396 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.241432  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4496  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.29 
 
 
396 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  27.7 
 
 
392 aa  123  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3132  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.54 
 
 
395 aa  123  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal  0.0111617 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0632  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.04 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  29.3 
 
 
408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4623  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.65 
 
 
396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.108824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4571  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.65 
 
 
396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4572  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.65 
 
 
396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0168981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4486  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.65 
 
 
396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4421  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.65 
 
 
396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100315 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.7 
 
 
416 aa  120  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0832  multiple sugar transport system substrate-binding protein  25.24 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.669088  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  27.51 
 
 
408 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.49 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0238  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.09 
 
 
396 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 
400 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5151  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 
400 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 
415 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  26.74 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.74 
 
 
400 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
418 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5891  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 
402 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.403986 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12290  maltose-binding periplasmic protein  26.78 
 
 
422 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0134652  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 
397 aa  107  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 
400 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04140  maltose-binding periplasmic protein  26.65 
 
 
449 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 
400 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0206  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 
433 aa  100  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568957  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0694  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 
415 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3325  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.49 
 
 
422 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1151  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 
400 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13860  maltose-binding periplasmic protein  26.21 
 
 
412 aa  92.8  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1853  maltose ABC transporter substrate binding protein  27.5 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225735  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0219  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.32 
 
 
423 aa  87  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000685496  hitchhiker  0.000000202467 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22450  maltose-binding periplasmic protein  25.85 
 
 
439 aa  86.7  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.326435  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2649  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1865  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
454 aa  84.3  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0986  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.265801 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1879  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0940  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.32 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69507  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1295  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5856  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
450 aa  79.7  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  21.7 
 
 
403 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2347  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
431 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1527  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3077  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1441  maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  26.9 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0332503  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3696  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 
546 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772784  normal  0.201816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>