234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0219 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0219  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 
423 aa  860    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000685496  hitchhiker  0.000000202467 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1853  maltose ABC transporter substrate binding protein  49.14 
 
 
409 aa  367  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225735  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1441  maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  40.39 
 
 
415 aa  298  9e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0332503  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1295  extracellular solute-binding protein  33.01 
 
 
409 aa  184  3e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2347  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
431 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1879  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
437 aa  123  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 
424 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 
410 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  27.48 
 
 
419 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 
411 aa  106  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 
400 aa  106  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3132  maltose ABC transporter periplasmic protein  28.07 
 
 
395 aa  106  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal  0.0111617 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 
410 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1276  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000485827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 
440 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  27.66 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2152  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
415 aa  94.4  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.410183  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 
415 aa  94  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  27.16 
 
 
419 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  27.16 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  27.16 
 
 
419 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  27.16 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  24.47 
 
 
392 aa  92.8  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  27.16 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
419 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.29 
 
 
416 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  27.16 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
419 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1485  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 
424 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  27.16 
 
 
419 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  25.32 
 
 
411 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 
439 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
393 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 
411 aa  90.1  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 
397 aa  89.7  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  25.06 
 
 
411 aa  89.7  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0294  maltose ABC transporter periplasmic protein  25 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.491527  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2135  maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein MalE  25.32 
 
 
410 aa  88.2  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 
425 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  26.41 
 
 
397 aa  86.3  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 
401 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  24.75 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  26.28 
 
 
467 aa  84.3  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 
418 aa  84  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  23.5 
 
 
408 aa  84  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 
392 aa  84  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 
401 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1781  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0744  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 
432 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0587531  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0238  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.74 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0940  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.12 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69507  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13860  maltose-binding periplasmic protein  20.93 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.87 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.87 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.87 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 
435 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03906  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.77 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3962  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4496  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.77 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03866  hypothetical protein  26.77 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5515  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.77 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.241432  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4274  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.77 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4586  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.77 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.66 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4421  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.27 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100315 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4486  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.27 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4571  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.27 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4572  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.27 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0168981 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4623  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.27 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.108824 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04140  maltose-binding periplasmic protein  20.91 
 
 
449 aa  77.8  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.34 
 
 
397 aa  77  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.93 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 
424 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2174  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.128166  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0832  multiple sugar transport system substrate-binding protein  22.65 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.669088  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0694  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 
415 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  22.14 
 
 
433 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5151  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22450  maltose-binding periplasmic protein  22.99 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.326435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.34 
 
 
431 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5891  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.403986 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.12 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 
436 aa  70.1  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3325  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25 
 
 
422 aa  69.7  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 
456 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0406  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00219397  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.5 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3077  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>