94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1879 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1879  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 437 aa  896    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2347  extracellular solute-binding protein  36.41 
 
 		 431 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1295  extracellular solute-binding protein  34.61 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0219  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.94 
 
 		 423 aa  123  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000685496  hitchhiker  0.000000202467 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1441  maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  26.58 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0332503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  24.94 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1853  maltose ABC transporter substrate binding protein  26.83 
 
 		 409 aa  110  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  25.18 
 
 		 419 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.18 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  25.18 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.18 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 419 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000013033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  25.18 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  25.18 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.18 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  24.94 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2152  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.410183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  26.08 
 
 		 413 aa  95.5  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 401 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2135  maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein MalE  26.22 
 
 		 410 aa  87.4  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1276  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000485827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  22.47 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  22.47 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  21.38 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 392 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  24.06 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  21.96 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  21.33 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  22.16 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  20.9 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4686  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.749978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3132  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.55 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal  0.0111617 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  21.63 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 460 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 395 aa  55.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0632  extracellular solute-binding protein family 1  22.46 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 425 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  20.69 
 
 		 414 aa  53.9  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  21.81 
 
 		 397 aa  53.5  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  20.92 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  20.92 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  22.68 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  21.29 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 442 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  23.86 
 
 		 467 aa  50.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 406 aa  50.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0694  extracellular solute-binding protein family 1  22.49 
 
 		 415 aa  50.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12290  maltose-binding periplasmic protein  22.58 
 
 		 422 aa  49.7  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0832  multiple sugar transport system substrate-binding protein  22.19 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.669088  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 457 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0744  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 432 aa  47  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0587531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5151  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1617  extracellular solute-binding protein  20.08 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  21.8 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  21.78 
 
 		 460 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  22.73 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  21.45 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 398 aa  44.3  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  20.36 
 
 		 431 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04140  maltose-binding periplasmic protein  22.7 
 
 		 449 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  20.9 
 
 		 416 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  20.9 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 400 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>